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體內RNA親和純化（RNA Affinity Purification, RAP）是根據感興趣的已知RNA序列，設計與RNA序列互補的生物素標記的DNA捕獲探針，同時將RNA與蛋白質在體內進行交聯，然后使用DNA捕獲探針，將與目的RNA結合的復合物沉淀下來，進行LC-MS/MS檢測，鑒定出目的RNA的結合蛋白。